蛋白质相互作用检测方法及分析是生命科学研究中的内容，它旨在揭示蛋白质与其他分子（包括蛋白质、核酸、小分子、离子等）之间的相互作用方式及其功能。蛋白质相互作用是细胞内信号传递、代谢调控和生理功能实现的基础，深入研究这些相互作用有助于揭示疾病发生机制、开发新型药物以及优化生物工程方案。随着技术的发展，多种蛋白质相互作用检测方法及分析工具被开发出来，为研究复杂的蛋白质网络提供了强有力的支持。蛋白质相互作用检测方法及分析在多个领域发挥作用：在疾病研究领域，通过检测疾病相关蛋白质的相互作用网络，研究者可以识别潜在的疾病靶点；例如，在肿瘤研究中，蛋白质相互作用分析帮助揭示驱动癌症发生的关键信号通路。在药物开发领域，蛋白质相互作用检测方法用于验证药物对靶点蛋白的调控效果并优化候选药物的设计。在农业与环境科学科学领域，蛋白质相互作用分析可用于研究植物对胁迫（如干旱、盐害）的分子响应机制，指导耐逆性状的改良。在功能研究领域，结合结构生物学和功能实验，蛋白质相互作用分析能够揭示复杂蛋白质复合物的组装及其功能实现机制。因此，蛋白质相互作用检测方法及分析成为生命科学领域的研究热点。

一、蛋白质相互作用检测方法的主要分类

蛋白质相互作用检测方法及分析根据研究环境和技术特点可以分为以下几类：

1、体内检测方法

体内检测方法直接在细胞或生物体内研究蛋白质相互作用，能够提供生理相关性的信息。

（1）酵母双杂交（Y2H）

酵母双杂交是一种经典的体内蛋白质相互作用检测方法，通过将两种蛋白分别融合至转录因子激活域和结合域，观察其相互作用是否激活下游报告基因表达。此方法高效、通量高，但容易产生假阳性结果。

（2）双分子荧光互补（BiFC）

BiFC将荧光蛋白分为两部分，分别与两种相互作用蛋白融合，当两种蛋白质结合时，荧光片段重新组装并发出荧光，直接可视化蛋白质相互作用。这种方法灵敏度高，但难以检测弱相互作用。

2、体外检测方法

体外检测方法在离体条件下研究蛋白质相互作用，具有高可控性和精确性。

（1）表面等离子体共振（SPR）

SPR是一种无标记实时监测蛋白质相互作用的技术，通过检测光反射角的变化，量化蛋白质与其配体的结合动力学和亲和力。这种方法灵敏度高，适合药物筛选和动力学研究。

（2）拉曼光谱结合技术

拉曼光谱通过分析分子振动特征，间接揭示蛋白质间的相互作用。与SPR类似，拉曼技术可用于实时监测和分析复杂的蛋白质-分子结合。

（3）亲和纯化结合质谱（AP-MS）

AP-MS通过抗体捕获目标蛋白及其相互作用伙伴，然后利用质谱技术鉴定复合物的组分，是研究复杂蛋白质复合物的有效方法。

3、高通量筛选方法

为了解析大规模的蛋白质网络，高通量筛选方法提供了效率与广度的平衡。

（1）蛋白质微阵列

蛋白质微阵列通过将大量不同蛋白质固定在固相基质上，检测其与目标分子的结合能力。这种方法适合快速筛选蛋白质-蛋白质或蛋白质-小分子相互作用。

（2）质谱定量相互作用分析（如SILAC）

SILAC是一种基于同位素标记的高通量定量方法，可与质谱联用，精准分析不同条件下的蛋白质相互作用网络。

4、成像技术

成像技术提供了蛋白质相互作用的可视化证据。

（1）荧光共振能量转移（FRET）

FRET利用两种荧光蛋白间的能量转移信号，直接测量蛋白质相互作用的空间距离及动态变化，是研究亚细胞水平相互作用的有力工具。

（2）共聚焦显微镜

结合荧光标记技术，共聚焦显微镜可以对活细胞中的蛋白质相互作用进行动态追踪，适用于研究亚细胞结构内的相互作用。

二、蛋白质相互作用检测方法及分析的未来发展

随着技术的进步，蛋白质相互作用检测方法及分析正朝着高通量、精确化和动态化方向发展。未来，结合人工智能和机器学习的蛋白质相互作用预测将极大地提升研究效率，同时多组学整合和单细胞水平的蛋白质相互作用研究将成为该领域的趋势，但是样本复杂性、动态范围和弱相互作用的检测仍是需要解决的技术挑战。

百泰派克生物科技为客户提供全面的蛋白质相互作用分析服务。我们采用先进的质谱技术、SPR系统及成像技术，结合专业的数据分析团队，为客户定制高质量的研究方案。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

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