癌症是一类高度异质性和复杂性的疾病，其发生发展涉及广泛的分子机制和生物路径。尽管现有治疗手段不断进步，但早期诊断依然是提高癌症治愈率的关键环节。生物标志物的筛选和验证，是实现早期诊断、疾病监测和疗效预测的重要路径。而在众多组学技术中，DIA（Data-Independent Acquisition）蛋白质组学正凭借其高通量、重现性强、低缺失率等优势，成为癌症生物标志物研究的关键技术平台。

一、蛋白质组层面的标志物探索意义

癌症标志物可用于识别肿瘤的发生状态、判断疾病进展风险、预测治疗响应甚至参与分子分型。虽然目前已知的生物标志物数量众多，但真正进入临床并广泛应用的仍属少数，主要瓶颈在于缺乏高通量、系统性的发现工具，尤其是在早期肿瘤或微量样本中的低丰度蛋白难以被可靠检测。蛋白质组学技术能直接捕捉细胞功能水平的信息，是比基因组和转录组更贴近生物表型的一种研究手段。通过高通量检测蛋白表达谱的变化，研究者可以更准确地识别癌症发生过程中涉及的关键蛋白通路和分子网络，从而筛选出具备生物学意义和临床价值的候选标志物。

二、DIA：重塑癌症蛋白质组研究模式

DIA是数据非依赖采集策略，核心特点在于对所有离子进行系统性、无偏见的扫描，不再依赖前体离子强度进行选择性碎裂。这种策略显著提升了数据的覆盖范围和重现性，是蛋白质组学迈向高通量、高一致性研究的关键一步。

📌对于癌症标志物的筛选来说，DIA的优势主要体现在以下几个方面：

• 低丰度蛋白检测能力强：标志物往往处于低表达状态，尤其在血液或其他体液中含量极低，DIA可提高其识别率；
• 数据完整性高，缺失率低：适合多样本、多批次的大规模比较分析；
• 实验重复性好：减少技术波动造成的噪音，提高候选标志物筛选的可信度；
• 结果可溯源、可追踪：支持对原始数据的多轮挖掘，为后续研究提供支持。

三、DIA技术在癌症标志物筛选中的应用路径

1、多样本队列构建与数据采集

研究通常从多个临床组别出发，如早期肿瘤、进展期、健康对照等，通过标准化的前处理流程获取组织或体液样本。DIA技术以其一致性强的采集模式确保数据在不同组别之间具备良好的可比性。

2、差异蛋白分析与通路注释

基于获得的DIA数据，研究人员使用统计方法对不同组别之间的蛋白表达水平进行比较，筛选出具有统计学显著性的差异蛋白。这些蛋白随后可被用于GO/KEGG通路富集分析，挖掘其在细胞信号通路、代谢调控、免疫反应等生物过程中可能发挥的作用。

3、候选标志物筛选与组合模型构建

筛选出的蛋白将根据其临床相关性、生物功能、检测便利性等维度进行初步排序。研究人员通常通过构建机器学习模型（如随机森林、LASSO等）筛选最具判别力的蛋白组合，用于开发多标志物诊断面板。

4、验证与功能研究

候选蛋白需通过正交技术如PRM、ELISA或免疫组化进行验证，并结合细胞或动物模型进行功能研究，以确认其与肿瘤发生发展的关联性。

四、DIA推动标志物研究标准化与可转化

临床应用对生物标志物提出更高要求，不仅关注其敏感性和特异性，还强调其可重复性、适用性和经济性。DIA技术由于其高度自动化和良好的数据结构，为蛋白质组数据的标准化提供了强大支撑。通过建设共享光谱库和统一分析流程，研究者可更高效地跨项目复用数据，推动多中心标志物研究的整合与协同。此外，DIA技术的发展也助力生物标志物从研究走向转化。一方面，通过与AI算法结合，可挖掘蛋白表达与疾病状态间更深层的非线性关系；另一方面，DIA已逐渐拓展至微量样本、液体活检等临床样本类型，为标志物在真实诊疗流程中的应用提供了实践基础。

癌症标志物的筛选之路需要严谨的科学设计和强有力的技术支持。DIA蛋白质组学技术凭借其出色的数据表现，正在为癌症标志物研究开辟新的思路与路径。它不仅提升了蛋白检测的广度与深度，更为实现标志物临床转化提供了可行的解决方案。百泰派克生物科技致力于提供高质量的DIA定量蛋白质组学服务，我们愿与您携手同行，为每一次科学探索注入精准、高效与信赖的力量。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

>>点击了解更多优质服务项目